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Menu Bienvenue sur la plate-forme 'Exploration du Métabolisme' uca logo metabohub logo IA @PFEM Ibisa

Plate-forme d'Exploration du métabolisme

https://www.clermont.inra.fr/plateforme_exploration_metabolisme

Catalogue des prestations 2018

Composante Métabolomique

Le catalogue suivant présente les prestations des composantes INRA et UCA en Métabolomique.

catalogue_metabo

Composante Protéomique

Séparation des protéines sur gel

  • 1D SDS PAGE
  • 2D SDS PAGE et Analyse d’image (sous conditions)

Identification des protéines

  • Préparation de l’échantillon avec extraction des protéines, purification et concentration des protéines (Bande 1D SDS PAGE)
  • Digestion enzymatique (en gel ou en solution)
  • Détermination de masse moléculaire
  • Analyse de séquence de peptides natifs ou de protéines recombinantes
  • Empreinte Peptidique Massique (EPM ou PMF)
  • Analyse par profils peptidiques ou de protéines
  • Analyse Shotgun (LC-MS/MS)

Quantification des protéines

  • Quantification relative Label Free (shotgun, logiciels Progenesis QI et MassChroQ)
  • Quantification ciblée SRM/PRM* (* bientôt proposée)

Modifications Post-traductionnelles

  • Phosphorylations
  • Autres modifications

Peptidomiques

  • Peptides bioactifs
  • Peptides biomarqueurs

Imagerie par spectrométrie de masse MALDI-TOF (proposé uniquement en collaboration)

  • Préparation des échantillons avec coupes histologiques, préparation des coupes avant analyse
  • Analyse carte ionique de peptides ou de protéines sur coupes (logiciel SCiLS)
  • Analyse statistique des résultats
  • Identification des ions par LESA (Liquide Extraction Surface Analysis)

Autres Services pouvant être proposés sous conditions

  • Analyse d’acides aminés (Dérivatisation PITC)