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Plate-forme d'Exploration du métabolisme

https://www.clermont.inra.fr/plateforme_exploration_metabolisme

Analyse de Données

La plate-forme dispose d'une architecture informatique en lien avec ses missions et à sa politique qualité. Les investissements matériels sont réguliers renforçant la sécurité et la mise à disposition d'outils de traitements de données. Deux statisticiennes, un bioinformaticien et un informaticien (3.6 ETP) complètent le personnel permanent et interviennent en support des activités analytiques.
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Pour garantir la sécurité des données analytiques, la PFEM dispose d'une plate-forme de stockage de près de 120 Tera Octets et de moyens de sauvegarde adaptés.

  • Côté métabolomique :

Pour faciliter le traitement des données de masse, la plate-forme participe activement à l'infrastructure Workflow4Metabolomics, et forme les chercheurs et les étudiants impliqués dans les projets externes aux étapes d''extraction, d'alignement et aux traitements statistiques des données.

La PFEM peut organiser des sessions de formations en fonction des besoins des utilisateurs sur l'analyse de données.

  • Côté protéomique :

La PFEM dispose d'un serveur dédié au logiciel Mascot®, couplé à Xtandem®.