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Plate-forme d'Exploration du métabolisme : des gènes aux métabolites

https://www.clermont.inra.fr/plateforme_exploration_metabolisme

Analyse de Données

La plate-forme dispose d'une architecture informatique en lien avec ses missions et à sa politique qualité. Depuis 2007, des investissements matériels ont été conduits renforçant la sécurité et les outils traitements de données. Deux statisticiens, un bioinformaticien et un informaticien (3.5 ETP) complètent le personnel permanent et interviennent en support des activités analytiques.

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Pour garantir la sécurité des données analytiques, la PFEM dispose d'une plate-forme de stockage de plusieurs Tera Octets et de moyens de sauvegarde adaptés.

  • Côté métabolomique :

Pour faciliter le traitement des données de masse, la plate-forme met à disposition des chercheurs et des étudiants impliqués dans les projets externes plusieurs machines dédiées à l'extraction, l'alignement et les traitements statistiques des données. Nous vous proposons la libre utilisation d'applications type MakerLynx®, Xcalibur®, XCMC® et R, Statistica® v09, SIMCAP®...

La PFEM peut organiser des sessions de formations en fonction des besoins des utilisateurs sur l'analyse de données.

Pour faciliter l'accès à ces ressources informatiques, il existe un système de réservation accessible depuis ce lien vers l'intranet du centre INRA de Clermont Theix Lyon.

  • Côté protéomique :

La PFEM dispose d'un serveur dédié au logiciel Mascot®, couplé à Xtandem®.

L'accès au serveur doit faire l'objet d'une demande d'ouverture de compte.

Un formulaire électronique sera prochainement disponible.